Realmente MSCONFIG, vai fazer seu pc iniciar mais rapido, mas se for vírus sugiro que actualize seu antivirus e rode, depois se mesmo assim não resolver, tente baixar um aplicativo chamado de CCleaner, muito bom, pois vai fazer uma limpeza no sistema, no registro, apagar arquivos desnecessário e tudo isso com bacupari, qualquer coisa erra você pode restaurar.
Ah! No CCleaner tem um MSCONFIG embutido.